联想DE6000H混合闪存阵列助力中科院上海药物所加速药物研发进程

中国科学院上海药物研究所创建于1932年,是我国历史最悠久的综合性创新药物研究机构,现有两院院士8人,973首席科学家7人、国家百千万人才12人。自建所以来,上海药物所共研发了100余种新药并投入生产,同时保持着每年申请并获授权国内外专利100多项、发表SCI论文400余篇的专业水准。上海药物所目前拥有四个国家级研究中心,并且还与国内外知名研究机构、本土企业、地方政府建立了战略合作伙伴关系。经过几代人的不懈努力,上海药物所已成为中国药物领域由仿制到创制的历史性转变中的中坚力量。作为中国最重要的创新药物研究基地之一,上海药物所将利用先进的IT技术和数字化管理方式进一步推动中国药物产业的高速发展。

老牌药物研究机构面临新挑战

飞速发展的数字化技术正在重塑新药研发与创新等医药实践,激增的数据如同未经加工的“原油”,为药物研发提供了大量原始材料。因此,数据管理和计算能力也成为了药物研发机构提高新药研发速度和成功率的关键。

近年来,中国新药创制研发产业在“国家重大科技专项”的推动下发展迅速。但身处数字化推动医药研发生产力变革的浪潮之中,若要稳步提升在国际市场中的竞争力,就必须加强IT基础设施建设,以应对加快新药研发的业务需求所带来的竞争压力。

对于中国科学院上海药物研究所而言,原有的高性能计算(HPC)系统已难以适应研发过程中愈发苛刻的数据计算需求。一方面,由各个部门自行选型搭建的HPC系统面临缺乏整体兼容性的问题;此外,原有HPC系统采用的“服务器+扩展柜”组合存在后端存储性能较差、扩展性不足、安全性较低、重建时间过长的弊病,因而需要一套全新的一体化HPC解决方案,来对研究所的数据进行管理和处理。

联想凌拓提供的DE6000H混合闪存阵列助力解难题

数据是当前药物研发和创新的关键点,处理速度过慢会降低新药研发的速度,而数据丢失也会阻碍科研进度,这些都将直接影响药物研究机构的市场竞争力。出于对科研数据安全性、可靠性、稳定性的考虑,中科院上海药物所采用了联想HPC解决方案。

通常,一套完整的HPC系统由计算、存储、网络、集群软件四部分组成,而存储决定了高性能计算I/O吞吐量的处理能力,因此对HPC系统的整体性能起到至关重要的作用。在不同类型的存储中,混合闪存能够将闪存的速度优势与HDD硬盘的容量优势相结合,同时允许上海药物所从原有的传统设备中逐渐过渡而不用承担同全闪存那样高额的成本。另外,考虑到混合闪存阵列与解决方案中部署的其他设备(包括联想ThinkSystem SR650服务器、联想RackSwitch G7028交换机、Mellanox SX6036交换机、联想智能超算智能平台LiCO)的兼容性问题,上海药物所在本次HPC系统的重新建设中,以联想凌拓提供的DE6000H混合闪存阵列取代了原先并无价格优势且性能略显逊色的扩展柜。

DE6000H混合闪存阵列为中科院上海药物研究所建设HPC系统提供了一系列直接有效的关键能力:

  • DE6000H混合闪存阵列采用双控全冗余架构,支持高达每秒21GB的读取带宽和每秒9GB的写入带宽,可实现99.9999%的高可用性;其中的图形性能工具的多种视图可提供有关存储I/O吞吐量的重要信息,帮助管理员进一步优化性能。
  • DE6000H混合闪存阵列拥有4U60高密度机头的可扩展性,同时采用模块化设计并提供简单的管理工具,因此可以轻松进行扩展。
  • DE6000H混合闪存阵列具备快照/卷拷贝、异步镜像、同步镜像功能,可以在本地或远距离上提供企业级数据保护,从而实现安全性的大幅度提升。
  • DE6000H混合闪存阵列搭载动态驱动器池(DDP),DPP动态重建技术可以在发生驱动器故障后,利用池中驱动器,通过把热备空间打散在所有硬盘上来加快重建速度,降低出现另一起故障的可能性,进而达到增强数据保护的目的。

“联想凌拓是中科院上海药物所信息化建设、数字化转型道路上值得信赖的有力伙伴。在本次项目中联想为我们提供了从需求分析、架构设计、资源分配、到原厂实施服务交付的一体化HPC解决方案。其中,凭借联想凌拓所提供的DE6000H混合闪存阵列,中科院上海药物所消除了原先HPC系统的性能瓶颈,加强了数据安全性,并为业务未来的进一步增长做好充分准备。接下来,我们将逐步执行HPC系统的改造升级,进一步增强综合IT服务能力。“

——黄子福,中国科学院上海药物研究所 信息化管理处处长

数据驱动药物研发能力提升

目前,上海药物所每天的数据处理量大约为1TB,数据中心存储的数据量大约为50TB,而每研发一种新药可产生15TB左右的数据量。借助高性能的DE6000H混合闪存阵列,上海药物所的数据处理速度可达到每秒4GB;同时依靠DE6000H混合闪存阵列高达“6个9”(99.9999%)的可用性,平均每年的意外停机时间成功减少了约20小时,为提高新药研发速度打下坚实基础。

此外,由于服务器坏盘的风险难以彻底规避,上海药物所的数据安全时刻面临着考验。DE6000H混合闪存阵列独特的DDP技术能够将服务器坏盘之后的重建速度从原来的24小时缩减至仅需数十分钟,有效避免了之前出现过的因重建时间过长,而导致系统性能大幅下降的状况。

DE6000H混合闪存阵列还兼备操作简便的优势,通过配合集成的数据保护功能,设置时间从原来的2~3小时减少至10分钟,大幅简化了上海药物所HPC系统的运维操作。利用这些节省出的时间,上海药物所可处理多达200GB的数据量,在顺利提升业务效率的同时节省了50%的运维成本。全球更低的IOPS价格 也减少了上海药物所在数据处理过程中的财务支出。

抓住IT升级机遇,踏上加速创新快车道

联想凌拓提供的DE6000H混合闪存阵列凭借领先业界的技术和超高的性价比,满足了中国科学院上海药物研究所对安全、可靠、高效的高性能计算的要求,构建了能够适应当下和未来医药科研趋势的IT环境,为上海药物所加速构建技术先进、无缝衔接、运行高效的综合性创新药物研发体系,并在激烈的国际竞争中脱颖而出提供了坚实的后盾。